Polícia v noci z 13. na 14. apríla 1950 zablokovala prístup ku kláštorom a rehoľníkov sústredili v kláštoroch Šaštín, Sv. Beňadik, Podolínec, Jasov, Pezinok. Mnoho kláštorných cenností bolo zničených. Došlo k zoštátneniu kláštorov. A tu sa začína nová a posledná etapa života P. Mikuláša Lexmanna. V Pezinku, Báči, Podolínci a v Králikoch.
Dňa 29. júna 1950 bol zatvorený veľký seminár v Košiciach. Náboženská výchova v školách bola obmedzená a zavádzal sa ateizmus.
Dekrétom č. 112 z 12. júla 1950 vláda zrušila 13 diecéznych seminárov v ČSR a ponechala len jeden v Čechách a jeden na Slovensku (Bratislava), teda aj košický seminár.
Cyril Hišem